氨基酸结构通式(氨基酸的结构与分类)

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氨基酸结构通式

本节重点
氨基酸的结构与分类要点:
结构:L型(α-C手性,除Gly),R侧链决定其性质
分类:20种常见+2种不常见;酸性(2种);碱性(3种);芳香族(3种)
在蛋白质中的分布:一般非极性氨基酸在内,带电荷和极性在外,但要看具体情况。
氨基酸的3字母缩写必须记忆

一氨基酸的结构相同的结构通式
不同氨基酸的R基不同,R基决定了氨基酸的性质
极性分子,兼性离子,一般都溶于水
天然蛋白质氨基酸均为L型(除Gly不具手性)
见22种氨基酸名称的来历
二氨基酸的分类按参与蛋白质构成:
基本氨基酸:天然氨基酸,有编码,20种常见(61个密码子编码)+2种不常见(Sec、Pyl,由2个终止子再特殊情况下编码)
稀有氨基酸:基本氨基酸修饰而来。
非蛋白质氨基酸:存在于生物体内但不组成蛋白质 (约150种),如D-氨基酸。
按营养需求分:
必需氨基酸、非必需氨基酸、半必需氨基酸(见生化记忆口诀之必需氨基酸)
按R基结构分类:
脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环族氨基酸
注意以下特点:
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸(含β-手性C)
含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸(含β-手性C)(-OH可连糖链)
含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巯基,高活性)、甲硫氨酸(可作甲基供体)
含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸(280nm吸收,Trp最强)
含咪唑基的氨基酸:组氨酸(碱性,最接近生理pH,唯一具有缓冲能力的氨基酸)
亚氨基酸:脯氨酸(刚性,打破α-螺旋)
含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺
碱性氨基酸:精氨酸(含胍基,碱性最强),赖氨酸(ε-氨基),组氨酸
酸性氨基酸:谷氨酸(最早发现)、天冬氨酸
按侧链R基极性分类:
非极性R基氨基酸,侧链无极性
极性R基氨基酸
注意:Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,不具旋光性,Gly的侧链介于极性与非极性之间,也把它归为非极性类。
三氨基酸在蛋白质中的常见分布非极性氨基酸一般形成蛋白质的疏水核心,带电荷的氨基酸和极性氨基酸位于表面。但要看具体情况:
Val、Pro、Phe、Ile、Leu:非极性,位于分子内部
Asp、Lys、His:极性,带电,位于分子外部。
Ala、Gly:侧链较小,疏水性和极性较小,可内可外。
Ser、Thr、Asn、Gln:不带电,极性侧链,可参与氢键而减少极性,可内可外。
Cys:不带电,极性,可参与二硫键形成而极性减弱,可内可外。
四氨基酸的缩写
21.硒代半胱氨酸(Selenocysteine):Sec、U
22.吡咯赖氨酸(Pyrrolysine):Pyl、O

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